近日,诺贝尔奖得主、美国华盛顿大学教授大卫·贝克(David Baker)和团队再次将 AI 成果送上 Nature,他们开发出一种基于 AI 的蛋白质结构生成模型 RFdiffusion,能在指定病毒表面特定表位的情况下,辅助人类从头设计出能够与之结合的抗体结构。
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(来源:https://www.ipd.uw.edu/david-baker/)
以前人们要想找到可以对付某种病毒的抗体,要么给动物注射病毒等它自己产生抗体,要么在成千上万个抗体里一个个试。现在不一样了,有了 RFdiffusion 只需要告诉它“我要一个能够紧紧抓住流感病毒某个位置的抗体”,它能够根据需求生成一个可能能和目标表位结合的全新抗体结构骨架,但是依然需要后续的序列设计和实验验证。
实验中,大卫·贝克团队设计了几种能够对抗病毒的抗体,冷冻电镜结